大正十二年、夜の東京に現れた「吸血鬼」たち。 古の時代からこの世界に隠れ住み、 闇に紛れて人の生き血をすする彼らを 勧誘または捕縛のため陸軍内部にヴァンパイアを中心に創設されたのが 第十六特務隊、通称『零機関』。 前田義信（CV: 諏訪部順一）、栗栖秀太郎（CV:畠中祐）、山上徳一（CV:山寺宏一）、スワ（CV:鈴村健一）、タケウチ（CV:石田彰）たちは、中島宗之助中将（CV:家中宏）に率いられ、今宵も彷徨える吸血鬼と対峙するのだった・・・。